根据《中国制造2025》的文件精神，清华大学软件学院、热能系、化工系为了促进在中国工业大数据的相关领域的科学研究，共同开展工业大数据系统与应用北京市重点实验室的工作。

2017年1月23日，国家发展改革委员会正式批复同意由清华大学作为承担单位牵头，北京理工大学作为参与单位，联合国防科学技术大学、中山大学、百度、腾讯等相关单位共同建设大数据系统软件国家工程实验室。

国家服务外包人力资源研究院，英文名称National Human Resources Institute for Service Outsourcing, Tsinghua University（英文缩写NISO），是由国家教育部、商务部二部2009年联合发文，依托清华大学设立的国家级研究院，孙家广院士为院长。研究院旨在解决当前我国现代服务产业发展中的人才困境难题，建立人力资源标准和评价体系，完善人才培养，为国家产业结构调整提供人力资源储备。

信息系统安全教育部重点实验室是2006年由教育部批准建设，2010年通过验收，是国内最旱开展信息系统安全研究的团队之一。历经十多年的发展，实验室先后承担了国家（973）重点基础研究发展计划、国家自然科学基金重大研究计划、国家（863）高科技研究发展计划、国家科技攻关、重大专项等多项重大和重点科研项目，在领域的信息系统可信性保障理论体系、异构泛化网络协议及软件代码的安全设计及漏洞防护机制、CPS环境下的下一代工业网络通信安全保障机制、基于领域信息模型的数据安全保障技术等方面开展研究工作，在国内外期刊和国际学术会议上已发表论文500余篇，获授权专利20余项，获得省部级奖励2项。实验室研究成果已应用到多个国家关键敏感领域，发挥了重要作用。

国家企业信息化应用支撑软件工程技术研究中心成立于1996年，隶属于国家科技部，以国家企业信息化建设需求为驱动，致力于解决企业信息化应用中具有关键性、基础性和共性的重大技术问题。