学院以推进软件工程教育教学改革，培养高素质、高层次、多样化、创造性的软件人才为使命，坚持以教学作为立院之本，确立“质量第一、素质与技术并重、理论与实践结合”的教学宗旨，遵循“练中学、练中闯、练中创”的实践教学理念，践行精品教育。学院以国家重大战略需求和国际学术前沿为导向适时更新教学内容，调整课程结构，修订培养方案，探索教学模式创新。2020年学院软件工程专业入选国家级一流本科专业建设点。孙家广教授、覃征教授获北京市高等学校教学名师称号。《软件工程》、《电子商务概论》被评为国家级精品课程；《软件工程》、《Web前端攻城狮》、《大数据系统基础》被评为国家精品在线开放课程；《软件理论基础》被评为国家级线上一流课程；《电子商务概论》、《Java程序设计教程（第2版）》被评为普通高等教育精品教材，另外还有5门课程被评为清华大学精品课。“服务国家重大战略需求，创建现代服务业创新创业人才培养标准与体系”获2012年北京市高等教育教学成果一等奖、清华大学教学成果特等奖；“建设创新课程，培养卓越软件工程师”获2014年国家级教学成果二等奖；“电子商务课程体系建设与实践”获2017年北京市高等教育教学成果一等奖。此外，多项教育改革成果获清华大学教学成果奖。