2013年5月22日，校长陈吉宁到软件学院调研，与学院教师就人才培养、人事制度改革、学科评估、学科规划等方面进行了调研座谈。

5月14日，清华大学软件学院刘云浩教授接受IEEE WiOpt 2013 (Intl. Symposium on Modeling and Optimization in Mobile, Ad Hoc, and Wireless Networks) 大会邀请，做了题为《GreenOrbs and CitySee: Lessons Learned from Extremely Large Scale Sensor Network Deployment》的主题报告，得到了参会者的热烈回应。

2013年4月25日至26日，清华软件日在清华大学FIT楼多功能厅举行。本次活动由清华大学软件学院主办，中法联合实验室LIAMA协办。

2013年4月27日上午9时，在清华大学校友会的支持及软件学院广大校友及师生的推动下，软件学院校友分会成立仪式在东主楼10区软件学院多功能厅举行。校友会副秘书长翦进、软件学院百余名历届校友及在校师生参加了仪式。

2013年4月25日下午，系统自适应建模和自动控制专家、中国科学院系统科学研究所院士陈翰馥应邀到我院作题为《系统辨识的递推方法》的学术报告。报告中，陈翰馥介绍了系统建模的背景、系统辨识领域中新的研究，特别近年来对线性系统和非线性系统的递推辨识研究所取得的进展。

2013年1月16日全天，软件学院召开年终总结表彰会。孙家广院长及院学术委员会主任刘云浩分别主持会议，全体教工近50人参会。

2012年11月28日，由清华大学软件学院核高基重大科技专项“非结构化数据管理系统” （LaUDMS）团队研发的关键技术成果“以图搜书”，随着盘古搜索公司阅读搜索系列产品的发布而正式上线运行，成为核高基专项支撑产业发展、推动技术进步的一个成功案例。

清华新闻网12月4日电 11月25日至28日，清华大学“Notemate云课堂”创业项目在同济大学举行的第七届“挑战杯”中国大学生创业计划竞赛决赛上获得金奖和最佳人气奖。

2012年11月4日，IEEE 院士、加拿大滑铁卢大学教授Andrew K.C. Wong一行4人前来清华大学软件学院信息系统与工程研究所进行学术交流，并做了题为“From Data to Knowledge: A Pattern Discovery Approach”的学术报告。

软件学院刘云浩教授与他的博士生李镇江等在ACM MobiCom 2012国际会议上获得大会唯一最佳系统演示奖（Best Demo Award）。